El museo principal abrió sus puertas en 1994 gracias a depósitos y donaciones de particulares. Este fondo museístico se muestra actualmente en cinco secciones: medio ambiente, fósiles, arqueología, etnología y numismática.

Forma parte también de la exposición permanente del museo el despacho de D. Gratiniano Baches, la primera persona que inicia los estudios arqueológicos en Pilar de la Horadada a principios del siglo pasado.